前回、新型コロナウイルスに対する抗体反応は、もともと人間が生まれついて持っている（germ line:GL）抗原反応部位遺伝子（V遺伝子）（Vgl）の組み合わせで、十分高い活性の抗体が形成されるため、ウイルス抗原に合わて突然変異を蓄積するという通常の成熟過程があまり必要でないことを紹介した（https://aasj.jp/news/watch/13476）。その後同じ結果を支持する論文が私が知る限りで２報発表されているので、人間はもともと活性の高い抗体を作れるように生まれついているのだろう。中和抗体を目指したワクチン開発には朗報と言える。
さらに、現在急速に進んでいる中和活性の高いモノクローナル抗体による治療開発も、実現は近いだろう。ウイルスに対する抗体が病気を悪化させる危険（ADE）も議論されているが、一旦中和活性のあるモノクローナル抗体まで到達すると、抗体分子に操作を加えることでADEを十分回避できる。高額ではあっても、治療の切り札の一つが手に入る日は近い。
しかし、ウイルス感染に対する免疫反応は、抗体反応だけではない。ウイルスがコードするタンパク質に対するT細胞反応が重要な鍵を握っている。いくらVglの組み合わせでいい抗体ができるとはいえ、反応が誘導されるためにはT細胞の助けが必要だ。さらに、多くのウイルスで、感染細胞標的にするキラー細胞がウイルス防御に重要な働きをすることが知られ、このようなウイルス特異的キラーT細胞を誘導できるワクチン開発が、様々なウイルスに対して進められている（https://aasj.jp/news/watch/12433 、https://aasj.jp/news/watch/13369）。
ただウイルスに対するT細胞の反応を調べるのは抗体を調べるよりはるかに難しい。というのも、ウイルス抗原（ウイルスのタンパク質から切り出される短いペプチド）を認識するためには、このペプチドが組織適合性抗原（MHC）と一緒に細胞の表面で提示されないと、T細胞は反応できない。そして最大の問題はこのMHCの組み合わせが個人個人で大きく違っており（だからこそ移植臓器拒絶が親子間でも起こる）、T細胞がウイルスペプチドを認識する確率は、どのMHCを持っているかで大きく変化することが知られている（https://aasj.jp/news/watch/12923）。
このように、ウイルスに対する免疫の議論には、抗体だけでなくウイルスに対するT細胞の反応を正確に測定することが必要になる。事実、困難を乗り越えてこの難しい課題にチャレンジした研究は読んでいても面白い。驚くことにLa Jolla研究所からの論文では、新型コロナウイルスに感染した人だけでなく、感染していない人にもT細胞免疫が成立していることが示唆された（https://aasj.jp/news/watch/13125）。
今日紹介するシンガポール・デューク大学からの論文は、この研究をさらに進めて、異なるコロナウイルス感染によりT細胞免疫が成立する可能性について調べた研究で7月15日号のNatureに掲載された。タイトルは「SARS-CoV-2-specific T cell immunity in cases of COVID-19 and SARS, and uninfected controls （Covid-19感染者、SARS感染者、および非感染者のSARS-CoV-2に対するT細胞免疫）」だ。
この研究では最初からコロナウイルス間でペプチド配列がよく似ている4種類のウイルスタンパク質に絞ってT細胞の反応を調べている。２つは構造タンパク質、NP-1,NP-2で、非構造タンパク質として選んだNSP7とNSP13はベータコロナウイルス間で完全な相同性が存在している。
これらのタンパク質からT細胞が認識すると予想できるペプチドを２１６種類作成し、４０種類ずつプールして刺激に用いている。T細胞は末梢血に存在するT細胞で、反応はペプチド刺激によるインターフェロン分泌、および刺激されたインターフェロン分泌T細胞の数をフローサイトメータで数える方法を用いている。全てシンガポール在住の成人で、半分がアジア系なので、我が国での免疫状況を考える意味で参考になる。
結果は以下のようにまとめることができる。
- 新型コロナウイルスに感染した後回復したひと達は、全員ウイルスの構造タンパク質NP1およびNP2由来ペプチドに対してT細胞免疫が成立しており、直接インターフェロン分泌T細胞数を調べたケースではCD4,CD8両方の反応が見られた。一方、NSP7,NSP13に対して一定程度以上の反応が見られたのは３割程度の人だった。
- 以前SARSに感染した人で調べると、低いレベルではあるがやはり新型コロナウイルスNP1,NP2に対する反応を見ることができる。そして、このとき反応するT細胞は、試験管内でもう一度刺激しなおすと、１００倍近い反応を示す。すなわち、刺激に反応して増殖し、さらに強い反応を示す記憶が成立している。
- SARSにも、新型コロナウイルスにも感染経験のない人を調べると、なんと半分以上の人（19/37）がウイルスペプチドにはっきり反応する。この反応も、SARSに感染歴のあるケースと同じで、試験管内で刺激に応じて細胞が増殖する記憶反応を示す。特に驚くのは、非感染者はベータコロナウイルス間で保存されたペプチドにだけ反応している点で、ベータコロナウイルスのNSP7やNSP13に対するT細胞記憶が、新型コロナウイルスでも動員される可能性が示された。
- 非感染者で実際に反応しているペプチドを特定し、その由来を探ると、人間のコロナウイルスより、動物が感染しているベータコロナウイルス由来である可能性が高い。
以上が結果で、新型コロナウイルスに対する免疫をT細胞の反応から見ると、今議論されているウイルス型といった細かな差異とは全く関係なく、ウイルス間の共通部分に対する複雑な交差性をもった記憶が成立していることを示している。すなわち、様々なベータコロナウイルスに対する感染歴により、新型コロナウイルスに対するT細胞免疫が、地域ごとに成立している可能性すら示唆している。
今ウイルスに対する免疫については、様々な説が展開されているようだが、我が国でもまずこのレベルの免疫反応検査を行った上で議論しないと、結局何も結論は出ないと思う。
ベータコロナウイルスに対する感染歴により、新型コロナウイルスに対する抵抗性が、
地域ごとに成立している可能性すら示唆している。
Imp：
山中伸弥先生提唱：ファクターXの重要な因子
発症前のウイルスが感染力を持つことが不思議でなりません。自然免疫は機能していないのでしょうか？自然免疫を回避して口腔、器官内細胞に潜伏でもしているのでしょうか？細胞内に潜伏したままで放出されて感染するなんてことが可能なのでしょうか？
無症状者からの感染を防ぐことさえできればと思わずにはいられません。
侵入時、私たちのシステムを使ってエンドゾームにもぐりこんだり、RNAをメチル化して感知されないようにしたり、IRF3が働きにくくしたり、インターフェロンシグナルをブロックスすためにSTAT1の核移行をブロックしたりと、自然免疫、特にインターフェロンを避けるための数々のメカニズムを備え、自然免疫が効きにくくなっています。
ウイルスが変異して感染力が10倍になっていると騒がれていますルスは校正遺伝子を持つという記事を以前に読んだ記憶があります。真偽は分かりませんが、RNAウイルスは変異しやすいとは言え都合のよい変異がかくも容易に起こるのはやはりとても意外です。
このウイルスは自然免疫をかわして細胞内に容易に侵入できるということなのに、発症までに時間がかかるのはなぜなのでしょうか？潜伏期間はウイルスの量が関係しているとよく説明されますが、このウイルスは＋鎖なのになぜすぐには増殖を始めないのでしょうか？ウイルスが細胞に侵入してその宿主を利用するよりも、障害したり、細胞死させることはウイルスに有利だとは思えません。
しかしそのような可能性を示唆する記事も？？
お持ちの疑問については、かなりわかっていますが、ぜひ自分で勉強してください。特に+鎖が侵入してからタンパク質ができる過程は圧巻に面白いです。
同じ＋鎖ssRNAであるフラビウイルス（日本脳炎やダニ媒介脳炎やデングや黄熱）ワクチンが、T細胞性免疫記憶において、交差性を示す可能性はありますか？
配列をよく見ないとわかりませんが、細胞性免疫を誘導するのはウイルスのタイプではなく、コードされているタンパク質のアミノ酸配列の類似性になります。コロナ同士でも同じペプチドが生成される確率は、高くないので、フラビウイルスとなると交差するペプチド配列は少ないのではないかと推察します。
でも、明らかにFactorXはフラビウイルス感染症のワクチンや感染歴のように世界中で見えるのですが。BCGではなく。日本医事新報5025号の「提言」記事を一度ご覧いただけませんでしょうか？
こんな文献も見つけましたが、関係ありそうでしょうか？勉強不足でよくわかりません。すみません。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25253338/
Overlapping and distinct molecular determinants dictating the antiviral activities of TRIM56 against flaviviruses and coronavirus
指摘は自然免疫の話の論文ですが、ここでの記憶は獲得免疫の話です。